O MCUC é hoje um espaço de conhecimento e de partilha. As suas primeiras coleções datam da Reforma Pombalina; promovia-se a ciência experimental, convidava-se à observação direta dos fenómenos naturais, dava-se a conhecer a natureza de lugares longínquos, então inacessíveis ao comum dos mortais. No século XVIII, foram criados o Laboratorio Chimico e o Gabinete de Física, para o ensino da química e da física experimentais. Na Galeria de História Natural encontram-se hoje exemplares que resultaram das recolhas feitas em África, Goa e Brasil, durante as chamadas viagens philosophicas empreendidas no século XVIII pelo Império Português, sob o patrocínio da Coroa. Hoje, prestamos homenagem às gerações passadas, que nos legaram o seu património, certas de que o iríamos respeitar e preservar, do mesmo modo que esperamos que as gerações futuras cuidem e respeitem o nosso. O MCUC tem por missão a preservação, o estudo e a catalogação das colecções científicas e históricas da UC, sendo a referência principal nesta área dentro da instituição.
O MCUC dá também a conhecer a ciência que se faz na Universidade de Coimbra, bem como a ciência que se faz em todo o mundo. Iniciativas como a Noite Europeia dos Investigadores aproximam cientistas e cidadãos, lembrando que temos de ser solidários com as gerações futuras, vivendo de modo sustentável, cuidando do mundo que habitamos, de modo a entregá-lo em condições de habitabilidade aos nossos sucessores, e preservando o património – material, cultural, natural - para que chegue em bom estado às suas mãos.
Mas não basta falar de ciência à comunidade. É preciso que a comunidade civil converse com os cientistas e lhe mostre os seus problemas e as suas soluções. É neste sentido que o MC promove colóquios e debates que têm como principal objetivo fortalecer e desenvolver o diálogo entre a comunidade científica, a sociedade civil e as autoridades locais. São disso exemplo os debates Homem Cidade Ciência, nos quais representantes de cada uma estão presentes em cada sessão, trazendo para o debate os seus pontos de vista e as suas dificuldades específicas. Estes colóquios têm vindo a criar espaço para a discussão de diversos aspetos da vida contemporânea, sejam a implementação de políticas públicas, ou iniciativas da sociedade civil organizada, ou ainda formas de integração social, e permitem fortalecer a comunicação, a interação, a divulgação da ciência e suas aplicações.